在不同的历史时期，崔氏族人对崔氏源流的“认知”经历了多次的演变。我们今天所知道的“崔氏源流”其实经历了千年里多次的修改。崔氏源流的演变过程可以按几个阶段来划分：

1. 先秦两汉时期（公元220年以前）

先秦两汉不乏记述姓氏起源的文献，是后世学者讨论姓氏起源的重要依据，但今存的《世本》佚文、东汉《风俗通·姓氏篇》佚文和东汉《潜夫论·志氏姓》均未见崔姓起源相关记载。

《左传》为最早提出崔氏出自齐国公族的文献。《左传·襄公二十五年》讲述崔武子（即崔杼）想娶东郭姜为妻，但是有臣提出崔氏出自齐丁公，而东郭氏出自齐桓公，两族同出一脉，不应联婚。这一说法在汉代的《白虎通·姓名篇》也被采纳。

《左传》提到的崔姓人物包括：崔夭，见《左传》僖公二十八年；崔如，见《左传》襄公二十三年；崔杼三子，见《左传》襄公二十七年，但崔夭、崔如、崔杼彼此的关系是什么，并没有记述，晋代杜预注也未补充说明。东汉高诱注《淮南子》有云“崔杼，齐大夫崔野之子”，但“崔野”仅此一见。

总的来说，两汉时期的史学家根据《左传》的记载，认定崔氏源出齐国公族，但对《左传》里崔姓人物的亲属关系并无不了解。东汉《潜夫论》的作者王符为博陵崔瑗的好友，他在撰写《志氏姓》时也没有提及崔姓起源，可见当时博陵崔氏望族也无法提供相关的史料。至少到东汉时期，崔氏族人对自己的起源认知只停留在齐国公族这里，并没有完整的先秦世系或谱牒。

2. 魏晋南北朝（220-589年）

到了南北朝，“食崔命氏”的说法已普遍被接纳。谱学家贾执的《姓氏英贤传》提出“自穆伯至沃、杼、成、良，代为卿大夫”，虽无法补缀先秦崔氏世系，但基本上提出史书里的这些崔姓人物为一脉相承的关系，其中“沃”或许是“夭”之讹误，后世也继续沿用了此说法。

从崔氏历代墓志铭看，自南北朝开始出现“清河、博陵崔氏同出一源”的说法，称秦东莱侯崔意如的两个儿子崔伯基和崔仲牟，分别为清河崔氏与博陵崔氏的先祖。其实早在明清时期已有史学家质疑这三人的真实性，其中最大的破绽在于他们的官职和生活时间与史不符。首先，秦汉之际并无东莱侯，东莱侯是在汉景帝时才设置的。另外，秦代封的侯爵可以世袭至汉代也与史不符，《汉书》、《后汉书》中更无记载。从以上提到的两汉姓氏著作来看，在东汉时期还没出现此说法，当为东汉以后才出现的。

南北朝裴松之的《三国志注》里提到有博陵