一、源自子姓

出自子姓，以王父为字氏。据《史记．孔子世家》所载：孔子，宋微子之后。宋闵公长子弗父何，弗父何生宋父周，周生世子胜，胜生正考父，考父生孔父嘉。五世亲尽，别为公族，为孔氏。孔父嘉生木金父，木金父生祁父，祁父生防叔。防叔畏华氏之逼，奔鲁。防叔生伯夏，伯夏生叔梁纥，叔梁纥生子孔丘。

二、源自姬姓

源于姬姓，出自春秋时期卫国大夫姬孔悝之后，属于以先祖名字为氏。春秋时期，卫国大夫中有姬孔悝，著名的孔子的弟子子路，就是在宫廷政变中为保卫姬孔悝而战死的。周敬王姬丐三十六年(鲁哀公姬将十一年，公元前484年)，当时孔子六十八岁，他结束了政治流亡生涯回到鲁国定居时，最喜爱的弟子子路仍然留在卫国做官。

在姬孔悝的后裔子孙中，有以先祖名字为姓氏者，称孔氏。

三、源自妫姓

源于妫姓，出自春秋时期陈国大夫孔宁，属于以先祖名字为氏。据史籍《古今姓氏书辨证》等有关资料记载，春秋时陈国(今河南淮阳)有个大夫叫妫孔宁。

在妫孔宁的后裔子孙中，有的以先祖名字为姓氏者，称孔氏，是为陈郡孔氏。

四、源自姬姓

源于姬姓，出自春秋时期郑穆公姬兰之后，属于以先祖名字为氏。据史籍《姓考》、《通志·氏族略》、《左传》等的记载：春秋时期，郑国(今河南新郑)君主郑穆公姬兰有后人名姬孔张，在其后裔子孙中，有以先祖名字为姓氏者，世代相传至今，史称郑国孔氏。

五、源自佶姓

另据《姓考》等书的记载，卫国（今河南滑县东）有出自古佶姓的孔氏。

六、源自满族

源于满族，属于汉化改姓为氏。据史籍《清朝通志·氏族略·满洲八旗姓》记载：

⑴满族崆果啰氏，亦称孔果洛氏，满语为Konggolo Hala，汉义“黄马”，世居黑龙江流域。后多冠汉姓为孔氏、广氏等。

⑵满族孔尼喇氏，满语为Kongnila Hala，世居黑龙江。后多冠汉姓为孔氏。

⑶满族叩岱氏，亦称阔代氏，满语为Kodai Hala，汉义“汉人的口袋”，世居哈达(今辽宁西丰小清河流域)。后多冠汉姓为孔氏。

⑷满族库雅拉氏，亦称揆雅拉，源出库雅拉女真，以部为姓，满语为Kuyala Hala，世居东海(今吉林汪清)、绥分(今绥分河上游地区)、乌拉(今吉林永吉)、虎尔哈(今黑龙江黑河对岸俄罗斯地区)、黑龙江流域、毕尔腾(今黑龙江牡丹江镜泊湖)、扎思胡里(今黑龙江第二牡丹江)、兴堪(今黑龙江省及俄罗斯兴凯湖周边地区)等地。后多冠汉姓为孔氏、胡氏、李氏、礼氏等。

⑸满族温都氏，亦称文都氏，源于金国时期温都部，以部为氏，与温敦氏、温屯氏同部族，满语为Wendu Hala，世居讷殷(今吉林抚松松花江上游流域)、绥分(今绥分河上游地区)、瓦尔喀(今南自长白山、图门江以北，北自黑龙江下游乌扎拉地方以南，东海岸则自俄罗斯滨海地区南，包括赫席赫、鄂漠和苏鲁、佛讷赫托克索等地)、乌苏里江等地，是满族最古老的姓氏之一。后多冠汉姓为孔氏、温氏、都氏、文氏、闻氏等。

⑹满族温屯氏，源出唐朝末期女真温敦部，以部为氏，与温都氏、温敦氏同部族，满语为Wentun Hala，世居乌拉(今吉林永吉)，是满族最古老的姓氏之一。后多冠汉姓为孔氏、空氏等。

七、源自其他少数民族

源于其他少数民族，属于汉化改姓为氏。在土家族、苗族、回族等少数民族中，均有孔氏族人分布，其来源大多是在唐、宋、元、明、清时期中央政府推行的羁糜政策及改土归流运动中，流改为汉姓孔氏，世代相传至今。