古代政府机构与官职
【三省六部】三省六部制是中国官制史的重大变革，它着封建政治制度的成熟。此后，历朝基本上沿用这种制度。
从唐朝开始正式设立的中央政权体系，分别为：
尚书省——最高行政机构，负责执行国家的重要政令；
门下省——审议机构，负责审核政令；
中书省——决策机构，负责草拟和颁发皇帝的诏令。
中书省——主要负责与皇帝讨论法案的起草，草拟皇帝诏令。
门下省——负责审查诏令内容，并根据情况退回给中书省。这两个部门是决策机构，通过审查的法令交由尚书省执行。
六 部：古代中央主要行政机构。隋初立吏、祠、度支、左户、都官、五兵六部。唐改祠部为礼部，度支为户部、左户为工部、都官为刑部、五兵为兵部，统归尚书省管辖。宋代沿用，元统归中书省管辖，明废中书省，各部独立，相沿到清末。其长官为尚书及侍郎，其中吏部为六部之首。
吏 部：六部之一。主管官吏任免、调动、封赏、改核等事。汉尚书有常侍曹，主管丞相御史公卿之事；东汉改为吏部曹，汉末又改为选部曹；魏晋以后都称为吏部。置尚书等官。班列秩序在各部之上。
户 部：朝廷掌管户口、财赋的官署，中央六部之一。周礼为地官大司徒之职。秦为治粟内史，两汉为大农令，又有尚书民曹，亦户部之职。三国至唐为度支、左民、右民、户曹、民部。唐永徽初，改为户部，五代至清因之。光绪末，改为度支部，管田赋、关税、厘金、公债、货币及银行等事。
兵 部：六部之一。主管中央及地方武官的选用、考查，以及有关兵籍、军械、军令等事宜。相当于周礼夏官大司马之职。魏至五兵尚书，至隋始改兵部尚书，历代王朝皆沿用，清末改官制止。
工 部：六部之一。掌管营造工程事项。如城市建设、水利、交通。汉代有民曹，魏晋以来有左民尚书、起部尚书，都是主管工役的官。隋代始设立工部，历代相沿。
刑 部：六部之一。主管国家法律、刑罚的政令。汉成帝时，有尚书三公曹，主管断狱；东汉改为三千石曹，为中都官，掌管水火、盗贼、词讼、罪法，也称贼曹。晋为三公尚书。南朝、宋朝以后改为都官尚书。隋开皇三年改为刑部尚书，历代相沿。清末改为法部。
礼 部：六部之一。掌礼乐、祭祀、宴乐、外宾礼仪及学校贡举的政令。后汉尚书吏曹兼齐祀。魏晋为祠部，北魏又称仪曹。后周有礼部而不言职事，隋唐皆为礼部。清末改为典礼院。
唐九寺：寺即官署。九寺即九卿之官署。汉以太常、光禄勋、卫尉、太仆、廷尉、大鸿胪、宗正、大司农、少府谓之九寺大卿。历代略有变动，迄于清皆因之。
光禄寺：掌宫廷宿卫及侍从，北齐以后兼掌膳食帐幕，唐以后始专司膳，历代因之。
太仆寺：掌舆马畜牧之事，北齐始曰太仆寺，清光绪改革官制时并入陆军部。
太常寺：秦署奉常，汉改太常，掌宗庙礼仪，至北齐始有太常寺，清末废。
宗正寺：明清为宗人府，掌天子宗族事。
大理寺：掌刑狱案件审理，秦汉为廷尉，北齐为大理寺，历代因之，清改为大理院。
卫尉寺：掌门卫屯兵，北齐改为卫尉寺，隋改为军器仪仗、帐幕之类，明废，清有銮仪卫。
鸿胪寺：秦曰典客，汉改大鸿胪，掌赞导相礼。鸿，声也，胪，传也，传声赞导，故曰鸿胪，至北齐曰鸿胪寺，清末废。
少府寺：掌山泽之事，后又掌宫中服饰衣物、宝货珍贵之物，隋改为监，历代因之，明始废。
太府寺：即大司农，掌钱谷金帛诸货币。
枢密院:唐代宗永泰中始置枢密使，以宦官为之，掌承受表奏。五代后梁为崇政院，改枢密使为崇政使，知院事。后唐时改为枢密院，为最高国务机关、主管国家军事机密、边防等。枢密院的长官称枢密使（或称枢密院事），参于朝政，和宰相分掌文武事，其权尤重。唐以后沿用。
丞 相：又称宰相，相国，为百官之长，是朝廷的最高行政长官，其职责是协助皇帝处理全国政务。唐时废丞相，而以中书门下平章事（简称平章事）、侍中、尚书令、仆射行使宰相职权。北宋因之，南宋时又改左，右仆射为左、右丞相。明朝则以内阁大学士行使丞相职权。秦时有相国和丞相。西汉末改称大司徒。东汉末复称丞相。元时中书省及行中书省置左、右丞相。太平天国也设丞相，是官阶不是职务，地位低于王、侯。
宰 相：历代辅佐皇帝，统率群僚、总揽政务的最高行政长官。宰相的名称历代不同：殷朝称尹，或阿衡、保衡。周朝春秋时称太师、太保、太宰。战国时称相国或丞相，独楚国称令尹。
内阁大学士：明、清两代掌管政务机构人员。明洪武十五年不设宰相，仿照宋制，置诸殿阁大学士（同宰相之职），收阅奏章，批阅文稿，辅助皇帝办理政务。中叶以后兼领六部尚书，成为皇帝的最高幕僚兼决策机关。清初以国史院、秘书院、弘文院、内三省为内阁，设大学士，参与军政机密，清末便徒有虚名。
大司马：周礼夏官有大司马，掌邦政。汉承秦制，置丞相、御史大夫，太尉。武帝元狩四年废太尉，设大司马，以冠将军之号，无印绶、官属。东汉改名太尉。明清用作兵部尚书的别称。
太 师：周时以太师、太傅、太保合称为“三公”。为辅佐国君的高官之一。秦代不置，而汉代每一个皇帝即位，都设太师、太傅、太保各一人，为重臣之首，而位在“三公”（大司徒、大司马、大司空）之上。西晋时，因避讳改太师为太宰，仍为最高官职。以后各代沿制，但三公之职一般只是一种荣衔，以示尊荣而无实职。另外，各代均设有太子太师一官，负辅导太子言行，传授知识之责。古代乐官之长，亦称太师。
少 师：周时以少师、少傅、少保合称为“三少”，亦辅佐国君之职，以后各代沿置，职位亦尊宠而无实权。其衡前加“太子”二字，如太子少师、太子少傅、太子少保，其职为教谕太子，为太子太师、太子太傅、太子太保之副职。
大将军：古代最高军事统帅之称，掌领兵作战。汉时，在大将军名号之上冠于大司马之号，其位更尊宠，权过三公。将军在秦时为军中高级武官之称。唐以后将军职位渐卑，成为武散官。宋、元、明的殿廷武士也称将军。清代的将军则是八旗军驻防各地的高级将领，此外将军亦作武官封赠之阶
大元帅：全军的统帅。辽以太子、亲王总军，有天下兵马大元帅、副元帅；又与大臣总军马之政，有大元帅、副元帅。
侍 郎：秦汉时郎中令的属官有侍郎，本为宫廷的近侍。东汉以后，尚书属官初任称郎中，满一年称尚书郎，三年称侍郎。隋唐以后，中书、门下及尚书省所属各部均以待郎为长官的副职，官位渐高。至明、清时升至正二品，以尚书同为各部的堂官。
御 史：为诸侯王亲近之职，掌文书及记事。秦置御史大夫，职副丞相，是监察机关的首脑，位甚尊，并以御史监郡，遂有弹劾纠察之权。西汉时称御史府是全国监察机关的首脑，汉以后御史职权累有变化，明、清仅存监察御史，分道行使纠察。
太 宰：1.相传殷始置设太宰、周亦名冢宰，为天官之长，辅佐帝王治理国家。春秋列国多称太宰。秦、汉、魏不设。晋改太师为太宰。隋唐时无此官。宋代崇宁间改左、右仆射为太宰、少宰。明、清时也用为吏部尚书的别称。2. 三代掌膳馔的官吏，亦称太宰。
令：朝廷中枢机构要职的长官称令，如令尹、中书令、尚书令等。汉代以后，中层机构的长官也称令，如明、清时宗人府所置宗人令、宗令等。又一县的行政长官也称令。秦、汉时，规定县官管辖万户以上称令，万户以下称长，明清又改为知县。
大学士：官名。唐、宋、明、清皆设。职权不一，宋以首相、次相分领；明初秩仅五品；清秩皆正一品，赞理机务，表率百僚，遂为宰相之职。
辅国将军：1.武散官，汉献帝置。2.清宗室封爵有十四等，十二等为辅国将军，位次镇国将军。
侍 中：秦、汉时为丞相的属官，因侍从皇帝左右，伺应杂事，可以出入宫禁，应对顾问，并代表皇帝与公卿议论朝政，为皇帝之亲信。至魏、晋其地位更重要，往往成为实际上的宰相。隋时为门下省的长官。唐时仍称侍中，官位崇高。
给事中：给事中三字，即是在殿廷内服务之意。凡大臣加给事中者，便可出入宫廷，接近皇帝。隋唐以后为门下省之要职。明代给事中分治六房之制，设六科给事中，即在吏、户、礼、兵、刑、工六科中每科设给事中一人，掌抄发章疏，稽查违误，权大势重。清代的给事中与御史无异。
参知政事：以资历较浅的官与宰相同议朝政，称参知政事，相当于副相，名为执政官，亦为中央最高政务长官。明代废。
尹：古代官名的通称，也用于国家官职的称谓。西周称天子辅弼之臣为师尹，春秋以后凡行政长官均称尹，如京北尹、河南尹，为京城的行政长官。地方设州尹、县尹，亦分别为州、县的行政长
史：官名，有太史，左、右史等称谓。其职责一般为掌管祭祀与记事，起草文书和记载国家政事。周时，太史为历官之史，权位较高。秦以后，则为掌管天文、历法之官。左、右史乃帝王身边的史官。《札祀》说:“动则左史书之，言则右史书之”。而《汉书》则认为古代是左史记言，右史记事，后世多采此说，并沿用此种制度。
大 夫：古代以大夫为官名，在诸侯国中有卿、大夫、士三级官职。而大夫又有上、中、下三等。秦汉以后，有身居朝廷国职的御史大夫、谏议大夫，有常议论备顾问的大中大夫、光禄大夫等，都是官称。到唐、宋时，置有御史大夫、谏议大夫。明、清则废。但隋、唐以后，大夫都是高级官阶的称号，一般高级文职官阶都称大夫，专为封赠之用；宋以后，称医生为大夫。
散 官：古代用于表示官员等级而无实际职务的官称。隋代开始设散官之制，以后各代均沿置。其品秩高低，待遇厚薄各不相同。文职散官有开府仪同三司、特进、光禄大夫等。武职散官有骠骑将军，辅国将军、镇军将军等。
太 常：官名。秦置奉常，汉景帝中元六年改为太常，为九卿之一，掌礼乐、郊庙、社稷事宜。至北齐时，设太常寺，有公卿、少卿各一人。清末废。
太 史：三代为史官及历官之长。秦称太史令，汉属太常，掌天文、历法。魏、晋时，修史撰文归著作郎，太史专掌天文历法。隋置太史监，唐初改太史局。元并设太史院与司天监。至明、清遂专于天文、占候之事归钦天监，史馆事多以翰林任之，故也称翰林为太史。
按察使：专主巡察，开元二十二年改称采方处置使，后改为观察处置使。元置提刑按察使。明仍建提刑按察使司，以按察使为一省司法长官。又名臬司，清末改为提法使。
刺 史：秦时此设刺史，监察各部。刺：检举不法；史：皇帝所使。汉武帝元封五年设部(州)刺史，督察郡国。官阶底于郡守，后改为州牧，魏、晋、南北朝时，各州都置刺史，并加将军之号，权力很大。隋以后为一州的行政长官，以后刺史成为太守的别称。唐时改州为郡，则称太守。宋亦属刺史，但属虚衔。
布政使：明朝将全国分为十三承宣布政使司，每司设左、右布政使一人，与按察史同为一省的最高行政长官。后来增设总督，巡抚等官，权位比布政使高，其后，布政使职权渐小。至清代仅为督、抚的幕僚，主管一省的财政和民政。
祭 酒：祭酒，是对尊者、老者的一种敬称。古时，飨宴酬酒祭神，必由尊者或老者一人举酒祭地，故称位尊重。西晋立国子学，设国子祭酒一人，为国子学之长。隋朝改为国子监察酒，即中央主管教育的机构，以祭酒为长官，历代相沿。至清未废。
安抚使:官名。隋云寿四年，设安抚大使，由行军主帅兼任。唐时各州如有水旱灾害，即派巡察，安抚或存抚等使节巡视抚恤;倘由节度使兼任，另有副使。宋代为掌管一方军事和民政之官，称安抚使，或称经略安抚使，常由知府、知州兼任。辽、金、元称安抚使，或称安抚司，只在远边地区设置。明清时，安抚使是西南边远地区的武职土官。
宣抚使：官名。唐德宗后，派朝臣巡视灾区，称宣抚安慰使，宋称安抚使，其职权如两汉大将军。元于西南地区置安抚司，参用土官，处理地方军政大事。明、清宣抚使皆土官世袭之职。
少 卿：官名。1.大卿的副职。2.北魏太和十五年设置的官，是正卿的副职，沿至清朝。
左、右都御史：明代设左、右都御使，为都察院的长官，正二品。负责监察纠劾事务，兼管审理重大案件和考核官吏。清代以左都御史为中央监察部门的最高长官。
中书舍人：中书省的属官。西晋初设置，历代名称和职务不尽相同。东晋至宋齐为中书通事舍人，隋唐初为内史舍人，隋焬帝时为内书舍人，武则天时为凤阁舍人。中书舍人原在中书省主管文书，职位低于中书侍郎。南朝后舍人的实权很大，起草诏令，参与机密到决断政务，往往代行宰相职务。隋代舍人主管诏令。唐掌管诏令、侍从、宣旨、接纳上奏文表等事。宋代主管中书六房（吏、户、礼、兵、刑、工）承办各项文书，起草有关诏令。明代有中书科舍人二十人，属内阁中书科，负责缮写文告、命令等事务。清代沿置。
修 撰：官名。唐代史馆，宋代翰林学士院，都有修撰官，掌修国史。元朝以进士第一名特授集贤院修撰。进士试一甲第一名(状元)，即授翰林院修撰、编修、检讨，列为史官，故俗称太史。自状元例授修撰一职以后，又称状元为殿撰。
员外郎：官名。员外，本指正员以外之官，晋武帝始设员外散骑常侍，员外散骑侍郎，简称员外郎。隋朝尚书省二十四司各设员外郎一人，待郎不在时，代行曹事。唐至清各部均有员外郎，位郎中之次。
左、右拾遗：官名。唐时置补阙、拾遗二官。负责进谏、荐举。唐代门下省称左省，中书省称右省，故属于门下省者，称左补阙、左拾遗;属于中书省者，称右补阙，右拾遗。北宋改为左、右司谏、左、右正言。南宋增至左、右补阙，左、右拾遗各一人。不久废。
谏议大夫：官员。秦朝置谏大夫掌论议，无定员，多至数十人。属郎中令。东汉时改为谏议大夫。隋朝属门下省。唐朝后，又分为左、右谏议大夫，分属门下省、中书省，并为谏院之长。明朝后期废。
防御使：官名。唐置防御使，位在团练使之下，凡大郡要害之地，则置之，以治军事，刺使兼之。代宗接位、诸州防御使并停，而令刺史兼团练，金朝州置。有防御州、节镇州之别。都属州官。
大 臣：古代官职尊贵者。清代用为官号。如内官有内大臣、军机大臣、总理各国事务大臣等；特派的称钦差大臣。至清末改各部尚书为大臣，侍郎为副大臣。
大 使：1、帝王特派的临时使节。2、唐制：节度使有节度大使、副大使、知节度事的分别。3、事务官称大使。如元朝京都二十二仓有仓大使，内藏各部有库大使。明清亦多沿用。
孙承宗（1563年—1638年），字稚绳，号恺阳，北直隶保定高阳（今河北）人。明末军事战略家。曾为明熹宗朱由校的老师。而后替代王在晋为蓟辽督师，修筑宁锦二百里防线，统领军队十一万，功勋卓著，遭到魏忠贤的妒忌，辞官回乡。皇太极包围京都时，朱由检急召孙承宗，运筹帷幄将清军击退。但不久之后孙承宗又遭到朝中大臣弹劾，孙承宗再次辞官回乡，在家高阳县住七年。累官至兵部尚书、太傅等。崇祯十一年（1638年），清军大举进攻，赋闲在家的孙承宗率全城军民守城，城破被擒，自缢而死，他的五个儿子、六个孙子、两个侄子、八个侄孙都战死。弘光元年（1644年），获南明追赠太师，谥号“文忠”。清高宗时追谥“忠定”。著有诗集《高阳集》、军事著作《车营扣答合编》。
人物生平
早期经历
孙承宗，字稚绳，相貌奇伟，胡须张开像戟一样，声音浑厚。早期为县里学生教授经学，后来在边关往来，喜欢和边关老兵交谈，询问一些关于边关防务的问题，慢慢的对边关的军务非常了解。
万历三十二年（1604年），孙承宗中进士第二名，授翰林院编修，而后转拜中允。
万历四十三年（1615年），张差手执木棍，闯进太子住的慈庆宫 ，打伤守门太监，被抓住后自称是受郑贵妃指使，朝中大臣怀疑是郑贵妃想谋害太子，但明神宗与太子都不愿深究，以疯癫奸徒罪将张差处死。大学士吴道南询问孙承宗这事该怎么处理，孙承宗说：“这件事关系到东宫，不能放任不理，但是又涉及到后宫，不能追查的太彻底。庞保、刘成以下的小人物要追查到底，庞保、刘成上面的人物牵扯太多，应当适可而止。”吴道南于是按孙承宗所说的去做，将此事平息了下来。
万历四十五年（1617年），孙承宗主持应天乡试，因为试题上写了孙承宗的语录，而遭到党人的忌恨，党人试图利用官员每三年一次的考核将孙承宗逐出京师，学士刘一燝力保孙承宗，孙承宗得以相安无事。
万历四十八年（1620年），明熹宗朱由校即位，孙承宗以左庶子充当日讲官。朱由校每天听孙承宗讲课，感觉自己受到了启发，于是特别关照孙承宗。
巡行辽东
天启元年（1621年），孙承宗官升少詹事。同年，后金入侵辽东，沈阳、辽阳先后被攻陷，辽东经略袁应泰自杀。御史方震孺奏请朱由校以孙承宗代替崔景荣为兵部尚书，朝中大臣也认为孙承宗知晓兵事，推举孙承宗为兵部添设侍郎，主持辽东防务。但朱由校不想让孙承宗离开自己，大臣们再三奏请都遭到拒绝。
天启二年（1622年），孙承宗被任命为礼部右侍郎。清军再次入侵，广宁城守王化贞弃城逃走，经略熊廷弼退守山海关。兵部尚书张鹤鸣害怕被降罪，于是外出巡行。朱由校于是拜孙承宗为兵部尚书，并兼任东阁大学士。孙承宗上书给皇帝朱由校说这几年没怎么练兵，军饷也难以核实，用武将上阵杀敌却用文官指挥，文官的权利太大，对作战极为不利。建议朱由校应该加大武将的权利，并且选一个有雄才大略的武将，给他假节的权利，让他可以自己任命帐下的偏将。朱由校在孙承宗的建议下，抚恤辽东百姓，精简京师军队，增设永平大帅，修建蓟镇亭障，开京东屯田等。孙承宗又奏请将熊廷弼、王化贞交给司法部门治罪，以正朝纲，又将给事中明时举、御史李达逮捕，治他们因招兵而引来战祸，又责备辽东巡按方震孺、登莱监军梁之垣、蓟州兵备邵可立，用以警告那些曲意依从，没有骨气的将领。很多人因为孙承宗受到责罚，对孙承宗感到敬畏，但也有很多怨恨孙承宗的人。
熊廷弼被罢免后，朝廷以王在晋为辽东经略。王在晋上任后打算袭取广宁，但总督王象乾认为就算能攻取广宁，但也不容易守住，还不如重守山海关防卫京都。于是王在晋在山海关外八里铺修筑重关，留四万人马去守。袁崇焕认为王在晋此举不是好的策略，与王在晋争辩无果后，上书给首辅叶向高。叶向高却认为不能凭主观猜测，于是孙承宗请求亲自前往辽东决断。朱由校非常高兴，加封孙承宗为太子太保，并赏赐蟒袍、玉带、银币等。
孙承宗到达山海关后，巡行边塞，袁崇焕向孙承宗请示道：“在宁远驻扎五千兵力，以壮十三山的声势，然后派遣将领带兵去救援十三山。宁远距离十三山只有两百里，可以轻易占据锦州，如果不行再退守宁远，怎么能放弃十万难民？”孙承宗于是与总督王象乾商议，王象乾认为驻扎关上的军队刚刚打了败仗，士气沮丧，不如调动插部护关的军队三千人前往宁远，孙承宗同意后一方面调兵前往宁远，一方面让王在晋去救难民，但王在晋却救援失败，十万难民只救回六千人。
孙承宗对此非常生气，询问王在晋：“新城修筑好以后，是不是要将旧城的兵马移四万人来驻守？”王在晋说：“不是，应该另外设立一支四万人的军队。”孙承宗说：“这样一来，八里铺就有八万兵了，可是一片石西北不派兵驻守吗？在八里铺内修筑重关，新城后面就是旧城，旧城前面埋的地雷是用来对付敌人的，还是用来对付自己新兵的？新城可以守的话，还用得着旧城吗？新城要是不能守，四万守兵倒戈，你是打算开关放敌人进来，还是闭关投降敌人？”王在晋说：“关外有三道关可以进入。”孙承宗说：“如果这样的话，敌人兵临城下，士兵像先前那样逃跑，哪里还用得上重关？”王在晋说：“准备在山上建三座营寨，防止士兵溃逃。”孙承宗说：“士兵没有溃败就修筑营寨等待他们，你这是在教士兵逃跑吗？况且逃跑的士兵可以进来，敌人也可以尾随他们进来。你现在不为恢复做打算，却在这闭关自守，把关外防线全部撤离，还天天在朝廷争斗，京都以东还有安宁之日吗？”王在晋无话可说，孙承宗于是召集诸将商议关外防守的问题。袁崇焕主张守宁远，阎鸣泰主张守觉华岛，王在晋主张守中前所。孙承宗采用袁崇焕的建议，并亲自镇守关门。而后明熹宗在孙承宗的建议下罢免了王在晋的辽东经略之职。
督师蓟辽
孙承宗于是自请为督师，还让蓟、辽等原来的将领监管各处，见机行事时不必受到其他人的限制。孙承宗用阎鸣泰为辽东巡抚，又用鹿善继、王则古为赞画，并请求从国库带走八十万钱。皇帝朱由校同意后，亲自将孙承宗送出宫门，并赐给孙承宗尚方宝剑、坐蟒等，内阁大臣将孙承宗直送到崇文门外。
孙承宗上任后，让江应诏制定军事编制，让袁崇焕建造营房，李秉诚训练火器装备，鹿善继、王则古处理军需物资，沈棨、杜应芳维修甲仗，孙元化修筑炮台，宋献、程仑购买军马，万有孚采伐树木，祖大寿辅助金冠守觉华岛，陈谏助赵率教守前屯，鲁之甲拯救难民，杨应乾招募辽人编制成军队。
孙承宗发现先前关上的士兵没有纪律，而且有大量的不符合条件的人冒领军饷，于是孙承宗阅兵后，将河南、真定等地不符合条件的士兵全部遣回。将鲁之甲所拯救出的难民征召七千人出来去驻守前屯，杨应乾招募的辽人军队去镇守宁远，请求朝鲜声援辽东，又犒赏东江镇的毛文龙，让他四面防卫。并传令给沈有容进据广鹿岛。而后江应诏被弹劾，孙承宗请求让马世龙代替，并让尤世禄、王世钦为南北帅，听马世龙调遣。朱由校听从孙承宗的建议并赐给马世龙尚方宝剑。
登莱巡抚袁可立与孙承宗同为天启二年殿试同考官，共同主辽期间满人蜷伏。孙承宗将辽海防务委之于袁可立，十分倚重。他说道：“读后先大疏，皎皎揭日月，行中天而底里洞彻，殊令人可味，可展布四体，仰酬国恩” （孙承宗《高阳集·答袁节寰登抚》）。
皇帝朱由校喜欢视察边关，经常派东厂的人到关门，然后将边关的事情上报给朝廷。魏忠贤掌权后派遣自己的党羽刘朝、胡良辅、纪用等四十五人带着数万武器装备来到关门，供给边关军队，又用白金十万，蟒、麒麟、狮子、虎、豹等银币赏赐将士，赐给孙承宗蟒服、白金等，表面上是慰劳军队，实际上是窥探军情。孙承宗出关巡视宁远，听到这个消息立刻上书给朱由校，说不能让宦官监军，但朱由校却回复说这没什么。使者到边关后，孙承宗只用茶水招待。
天启三年（1623年）孙承宗推荐阎鸣泰当辽东巡抚以后，认为他没有实际才能，所以军事上的事很多都不跟他商议，阎鸣泰因此感到不高兴，朝廷议论后，将阎鸣泰罢免，用张凤翼接替，但张凤翼胆小，又主张退守山海关。孙承宗对此感到不高兴，出关巡视宁远，着急众将开会，多数将领都想退守山海关，马世龙建议守中后所，袁崇焕等主张守宁远。孙承宗采用袁崇焕的主张，于是让祖大寿修建防御工事，令袁崇焕、满桂驻守宁远。
孙承宗担心自己的权利受到限制，上书朱由校说督师和总督不能同时设立，请求将自己罢免。朱由校于是终止总督的推选，令辽东巡抚移驻宁远，张凤翼觉得这是置自己于死地，与万有孚等诋毁马世龙。没过多久，万有孚被蓟州巡抚岳和声弹劾，张凤翼于是称马世龙和袁崇焕陷害，捏造谎话期满朝廷，试图阻挠出关的计划。给事中解学龙也大力陈说马世龙的罪过，孙承宗非常生气，上书给朱由校说边关的防守策略，说宁远、觉华不能放弃，并为马世龙辩解，又揭发万有孚与张凤翼等勾结的罪状。
天启四年（1624年），宁远城修复，关外的守备器械也已建造完毕，孙承宗上书朱由校请求发军饷二十四万，这样就可以大举进攻了，但兵部和工部却横加阻挠，劝谏朱由校不能给钱，孙承宗上书催促无果，孙承宗大军因此没有出征。
孙承宗坐镇辽东的四年，与天津巡抚李邦华、登莱巡抚袁可立遥相呼应，“关门息警，中朝宴然，不复以边事为虑矣。”在这样相对安定的大背景下，按照战功来衡量，似乎孙承宗有些碌碌无为。然当时的兵部尚书王永光对孙承宗和袁可立积极防御的一番作为作过很中肯的评价：“兵家有云，善战者，无赫赫之功！”孙阁老之所以打的都是小仗，是因为建奴知道他能打仗，再加上袁军门的水军牵制，后金不肯贸然来碰他的霉头，所以两年下来，孙阁老和袁军门一直没有发动大战役的机会，而发动战略总反攻把后金赶出去的机会又不成熟。但反过来说，孙阁老在无形中为朝廷省下了许多军费，确保了山海关安然无恙，使明朝有了更多的机会养精蓄锐，充分显示了天朝的不战之威。”首辅孔贞运评价道：“公久历海上，凡地形险易，军储盈缩，将吏能否，虏情向背皆洞若烛照，故登莱终公（袁可立）之任销锋卧鼓。”（《兵部尚书节寰袁公墓志铭》）这也从另一方面肯定了孙承宗和袁可立积极防御之功。令人惋惜的是，正当孙、袁二公积数年之力准备大有作为组织大反攻之时，阉党已全面乱政，逼迫袁可立和孙承宗先后去职。
辞官归乡
而此时魏忠贤企图扩张权利，见到孙承宗功劳非常高，想要攀附，于是派刘应坤向孙承宗表明自己的意思。但孙承宗见到刘应坤之后与他一句话也不说，魏忠贤因此记恨孙承宗。魏忠贤迫害朝中大臣，将杨涟、赵南星、高攀龙等驱逐出京，孙承宗正在巡视蓟州一带，想到上反对奏书皇上未必会亲自阅览，于是以贺寿为由请求入朝面奏，借机弹劾魏忠贤。魏广微听说后将这个消息告诉了魏忠贤，说孙承宗打算以清君侧为由杀掉魏忠贤，魏忠贤于是跑到皇帝朱由校床前，哭着求情，顾秉谦也说没有圣旨私自离开防守的地方，不合法度。于是朱由校连夜召见兵部尚书，派三人骑快马阻止孙承宗。魏忠贤又假传圣旨给九门的宦官，若孙承宗到了齐化门，就将他绑了。孙承宗到达通州后，接到朱由校的旨意，只好返回辽东。魏忠贤又让党羽李蕃、崔呈秀、徐大化上书诋毁孙承宗。孙承宗于是请求罢官。
天启五年（1625年），给事中郭兴治请求朝中大臣讨论孙承宗的去留问题，很多人都弹劾孙承宗说他冒领军饷，而吏部尚书崔景荣支持孙承宗，朱由校于是下诏让孙承宗继续督师辽东，却让孙承宗精兵简将，减少军饷。而孙承宗刚刚派遣诸将分别驻守锦州、大小凌河、松山、杏山、石屯等地，扩张二百里，将尤世禄、李秉诚等将罢免，裁剪军队一万七千人，节省开支六十八万。
同年九月，马世龙误信降人降将刘伯漒，派鲁之甲、李承先袭取耀州，中计身死，损失四百余人。于是魏忠贤党羽趁机弹劾马世龙和孙承宗，孙承宗于是强烈请求辞官，十月，朱由校同意孙承宗辞官，并给孙承宗加特进光禄大夫，儿子世袭中书舍人，又赏赐蟒服、银币等，并派人保护孙承宗回家。而让兵部尚书高第为辽东经略。没过多久，安性也罢官，朱由校于是不再设立巡抚。
天启六年（1626年），高第上任后，将两百里守兵全部撤回，退守山海关。而清努尔哈赤得知孙承宗辞职后，率军大举进攻。袁崇焕抗拒高第的命令，不肯撤出宁远城，与满桂、祖大寿等依靠昔日与孙承宗做的军事准备将清军击退，取得宁远大捷。而高第却试图以宁远被围，关门兵只有五万弹劾孙承宗，孙承宗告诉户部说：“高第到山海关时领了十一万七千人的军饷，现在只给五万人的军饷就可以了。”于是高第以妄言被治罪。魏忠贤也想陷害孙承宗，但也失败。
孙承宗在督师辽东四年，前后修复九座大城，四十五座堡垒，招练兵马十一万，建立十二个车营、五个水营、两个火器营，八个前锋后劲营，制造甲胄、军用器械、弓矢、炮石等打仗用的装备有几百万，开疆扩土四百里，屯田五千顷，年收入十五万。朱由校记孙承宗大功，让他的儿子世袭锦衣卫千户。
力挽狂澜
崇祯元年（1628年），明熹宗驾崩，明思宗朱由检即位，王在晋得以入朝为兵部尚书，王在晋十分怨恨孙承宗，于是极力诋毁孙承宗以及马世龙，阻拦孙承宗的出仕。
崇祯二年（1629年），袁崇焕先前为魏忠贤建立生祠，又擅自与清军讲和，后来为议和又设计矫诏将牵制清军的东江毛文龙杀死，将登莱巡抚袁可立积数年之力经营的海上防务瓦解殆尽。同年十一月，清军大举进攻，从大安口直取遵化，快要直逼都城。朝中大臣奏请朱由检应该召来孙承宗。于是朱由检下诏仍以孙承宗原来的官职兼任兵部尚书去驻守通州。孙承宗入宫后，朱由检在平台召见，问孙承宗的退敌策略，孙承宗说：”我听说袁崇焕驻守蓟州，满桂驻守顺义，侯世禄驻守三河，这是防守的好策略。但又听说尤世威回昌平，侯世禄驻守通州，有些不合时宜。“朱由检问：”你打算守三河是什么意思？“孙承宗说：”守三河可以阻止敌人西奔，遏制敌人南下。“朱由检觉得孙承宗的计策很好，又问：”那又要怎么保卫京都。“孙承宗说：”在危急的时刻，不能让守城人忍受饥饿寒冷，整备好军备，犒劳将士们，巩固人心。“孙承宗的计策朱由检都觉得很好，于是对孙承宗说：”你可以不去通州，就在京城总督内外军务，运筹帷幄。“于是孙承宗让首辅韩爌修筑关防，又亲自到都城各处巡防，第二天半夜，朱由检突然传旨让孙承宗去守通州。孙承宗于是领二十七名骑兵出东便门，直奔通州，与保定巡抚解经传、御史方大任、总兵杨国栋固守通州。但不久之后，清军绕道直逼京都，孙承宗于是派遣尤岱率领三千骑兵支援，派遣刘国柱率领二千兵马与尤岱回合，调三千密云兵驻守东直门，五千保定兵驻守广宁门，又派人收复马兰、三屯二城。
同年十二月，袁崇焕因一系列罪行被下狱，将领祖大寿在城外与清军作战时被自家军队用炮石砸击，祖大寿进退两难，与副将何可纲率领五千人往东溃走。孙承宗得知后，急忙派遣贾登科带着自己的书信去抚慰祖大寿，又派石柱国抚慰其它将士。祖大寿却不为所动。但孙承宗也认为袁崇焕有罪，但仍然上书朱由检，力保祖大寿，说祖大寿不会真的反叛。孙承宗又派人让祖大寿上奏章说明自己为什么往东溃逃，祖大寿于是向皇帝朱由检上书，朱由检非常高兴，不怪罪祖大寿。而辽东将士大多马世龙部曲，朱由检命孙承宗移镇关门，溃逃的将领听闻孙承宗与马世龙到来，才安心回归。
崇祯三年（1630年），清军占据遵化、永平、迁安，又分兵攻取抚宁，抚宁是史可法在守，清军攻取不下，又转攻山海关，又攻不下，于是清军又攻抚宁及昌黎，可还是攻不下。而孙承宗抚慰溃军，祖大寿等重归于麾下，又有马世龙及四方援军，孙承宗又招募大量死士沿海守卫直达京师。
京都戒严后，全国各地来勤王的士兵多达二十万，在蓟门及京畿一带驻扎。马世龙于是建议孙承宗先收复遵化，但孙承宗认为遵化在北，容易攻取却很难守，不如收复滦州。计划好后，孙承宗于是令东西各营一起进兵。五月，祖大寿、尤世禄等攻克滦州，王维城等攻克迁安，孙承宗占据永平，谢尚政攻克遵化，清军溃败而走。皇帝朱由检于是加封孙承宗为太傅，再赐蟒服、金币等，子孙世袭锦衣卫指挥佥事。孙承宗请辞太傅，又称病想回家，但朱由检不准。
崇祯四年（1631年），孙承宗巡视松山、锦州等，上书朱由检关内外政事，朱由检全部采纳，又加孙承宗太傅，兼领尚书的封路，子孙世袭尚宝司丞，又赏赐蟒服钱币等。
同年七月，因先前高第尽撤宁锦防线，右屯、大凌河等城被毁，孙承宗派人对其进行重新修筑，但不久之后清军却突然来围攻。孙承宗赶赴锦州，派遣吴襄、宋伟前往救援，而辽东巡抚邱禾嘉多次改变出师的日期，导致吴襄、宋伟在长山被清军大败。十月，祖大寿投降，大凌河刚被修好就被损毁。朝中大臣于是责怪孙承宗修复旧城导致失败，丧师辱国。孙承宗于是以病请辞。孙承宗又上书边关政务共计十六件事，但朱由检见书后却不采纳。孙承宗于是在高阳城居住七年，朱由检屡次召用，孙承宗全都拒绝。
满门壮烈
崇祯十一年（1638年），清军大举进攻，十一月，进攻高阳。赋闲在家的孙承宗率全城军民守城，城破被擒，自缢而死（《初学集》、《明史》及民国版《高阳县志》等均持此说，另一说为清兵所杀）。他的五个儿子，六个孙子，两个侄子，八个侄孙战死，孙家百余人遇难。孙承宗时年七十六岁。朱由检闻讯后哀伤悲叹，命有关官员从优抚恤。但仅复原职、赐祭葬，并未有赠谥。
弘光元年（1644年）九月十三日，南明朱由菘追赠孙承宗太师，谥号“文忠”（一作“文正”）。
清朝乾隆年间，撰《钦定胜朝殉节诸臣录》，追谥孙承宗“忠定”。
