源流一

源于少昊，殷之后裔。据唐代张九龄编撰的《姓源韵谱》记载：“少昊之子殷，为工正，封尹城，后因氏焉”。中唐时期林宝编撰的《元和姓纂》记载道："少昊之子，封于尹城，因氏焉”。少昊是远古时期羲和部落的后裔、古代东夷族首领，少昊之子殷为工正，被封于尹城，子孙以此为氏。

关于少昊之子殷的身份，南宋学者罗泌的《路史》中记载为“少昊之子般”，来自《山海经》中“小昊次妃之子般”，不足以作为依据。

源流二

源于西周内史兮甲，以官得姓。据《风俗通义》所载：兮甲，字伯吉甫，是周宣王的中兴大臣，担任的官职是内史。西周时内史又称“内史尹”或“作册尹”，简称“尹”，世称兮伯吉甫为“尹吉甫”。兮伯吉甫死后，嫡子伯封承袭了官职。西周灭亡后，伯封跟随周平王东迁获得了封邑，称“尹邑”（今河南新安县），属周王朝的畿内国。公元前516年，尹国兵败灭亡，国人遂以“尹”为姓氏。

源流三

出自芈姓。芈姓源于南方楚国，为“荆楚十八姓 ”之祖，后有部分衍化为尹氏。

源流四

出自少数民族汉化改姓。据史籍《清朝通志·氏族略》记载，蒙古族博尔济吉特氏、叶古禄特氏、音斋氏有汉化尹姓；满族、锡伯族章佳氏有汉化为尹氏者；今白族、苗族、壮族、朝鲜族等均有尹姓分布。