孔子之后，接连七代单传，孔子娶妻亓官氏，生独子孔鲤，孔鲤生独子孔伋，孔伋生独子孔白，孔白生独子孔求，孔求生独子孔箕，孔箕生独子孔穿，孔穿生独子孔谦。孔谦生三子：孔鲋、孔腾、孔树，此三人为第九代。 孔鲋这一支的情况是：孔鲋生孔元路，第十一、十二、十三代失考，第十四代孔吉，孔吉生子孔何齐，孔何齐生子孔安，孔安无嗣。至此，孔鲋这一支失传。 孔树这一支的情况是：孔树生子孔聚，孔聚生之孔臧，十二、十三两代失考，第十四代为孔宜，此后这一支因嫡传绝嗣而失传。 现在有谱可考的孔氏宗族，是孔腾之后。汉高祖封孔腾为奉祀君。孔腾生子孔忠，孔忠生子孔武。汉元帝年间，孔子十三代孙孔霸被赐爵关内侯，封褒成君。此后直至唐玄宗开元年间，孔氏裔孙多数得以袭封侯的爵位，孔氏逐渐发展为一个显赫的家族。 随着家族的繁衍生息扩大，越来越多的族裔由山东迁到其他省份，迁移的主要原因是出任官职，其次是躲避战乱。在唐代，有影响的孔氏郡望主要有：会稽山阴（今浙江绍兴）、鲁国（今山东曲阜）、下博（今河北深县东南）、常山（今河北正定）、南阳（今河南西南部）。唐代中后期开始，较有影响的各地支系逐渐定局，比如宁陵系、丹阳系、临江系、南雄系、献县系、鲁山系、浏阳系、郏县系、桂东系、岭南系、庐江系、平阳系，等。 唐玄宗开元五年（公元714年），孔子三十五代裔孙孔璲之袭封褒圣侯，又晋为文宣公，后其曾孙孔惟晊袭封文宣公。唐末，政纲弛堕，社会动荡，孔氏宗族势力锐减，唐哀帝天祐二年（公元905年），四十二代嫡孙孔光嗣失去文宣公爵位，被任命为泗水主簿。孔府中一杂役孔末（本名刘末）伺机作乱，杀死孔光嗣夫妇，孔光嗣九岁的儿子孔仁玉幸得逃脱。到后唐长兴元年（公元930年），孔仁玉经科举考试晋为太学生，上书朝廷告发孔末，朝廷将孔末正法，孔仁玉重新入住孔府，受封文宣公，并任龚邱令，后世族人尊孔仁玉为“中兴祖”。 孔仁玉生四子：孔宜、孔宪、孔冕、孔勖，孔宪两传失传，孔冕一传失传，孔宜和孔勖的后代繁衍甚重，孔宜生二子：孔延世、孔延泽，孔延世传至四十六代孔圣佑而绝嗣，孔延泽之子四十六代孔宗愿封号由文宣公改为衍圣公，孔勖生三子：孔道辅、孔良辅、孔彦辅。到元初时，居住曲阜的孔仁玉的后人已扩展为20家，后世称“孔氏二十派”。元末明初又续分为六十支，后世称“孔氏六十户”。 南宋高宗建炎二年（公元1128年），孔子四十八代孙衍圣公孔端友奉诏自曲阜赴扬州，由于金兵势盛，孔端友和部分孔子后裔随驾南渡，高宗赐其定居衢州，兴建家庙，供奉孔子夫妇，礼仪如曲阜，这样就形成了孔氏南宗。孔氏南宗以衢州为中心不断扩大，南宋先后封孔端友、孔玠、孔搢、孔文远、孔万春、孔洙六代衍圣公，孔氏族人也得到重任。 金国入主中原后，建立了伪齐政权，刘豫于阜昌二年（公元1131年）封孔端友之弟孔端操之子孔璠为衍圣公，主持曲阜孔子林庙祭事。伪齐政权垮台后，金熙宗仍封孔璠为衍圣公。这样，孔氏北宗也形成了。在南宋时期，北宗袭封衍圣公的先后有孔拯、孔元措、孔浈（孔元措之弟孔元宏之孙）。 后五十一代孔元措随金政权迁往汴州。宝庆元年（公元1225年），宋军收复山东，立孔元措族兄孔元用为衍圣公，宝庆二年，改授孔元用之子孔之全。蒙古族政权占领山东后，承认了孔之全衍圣公身份。同一时期，形成了南宋、金、元三家朝廷各有一个衍圣公的局面。元太宗五年（公元1233年），元朝攻下汴京，又改封孔元措为衍圣公，孔之全改任曲阜县令并子孙世袭。元朝统一中国后，世祖按照“大宗之法”钦定南宗为衍圣公，令其返回曲阜奉祀，至元十九年（公元1282年），南宗第六代衍圣公孔洙奉诏入京，秉称不忍弃离祖庙，愿将衍圣公爵位让与北宗族弟孔治（孔之全之子），世祖赞誉，准其所请，免去衍圣公称号，改任国子监祭酒、承务郎，兼提举浙东学校事。从此，南宗失去了世袭的衍圣公爵号。元成宗元年（1295年），封孔治为衍圣公。孔治死后，其子孔思诚袭封，后遭罢黜，孔思晦袭封。 明太祖朱元璋承认元朝所封衍圣公为正宗，其后的清代继续以之为正宗。一直到不久前去世的七十七代孔德成，均是元代所封衍圣公孔思晦的后裔，皆按照严格的宗法制度，以嫡长子承袭。 衍圣公的世袭有着严格的宗法制度。从北宋至和二年（公元1055年），宋仁宗赵祯封孔子四十六代孙孔宗愿衍圣公起，衍圣公的世袭爵号前后沿袭了880年，至中华民国24年（公元1935年），在“五四”新文化运动的社会背景下，中华民国政府废除封建封爵制度，改封孔子七十七代孙孔德成为大成至圣先师奉祀官，共传32代，共有41人承袭爵位。 到明朝初年，居于曲阜的孔氏族人人丁已超过万人。大批孔氏后裔逃避战乱流寓外地，居于曲阜的裔孙也相继散居各处。天启年间，孔氏家族将各宗族支派划分为五十七个宗族。到清康熙年间，孔氏后裔已繁衍到二万余丁，于是又增为六十个宗户，每个宗户为一个族派，后世称“孔氏六十户”，他们大部分居于曲阜，又称“曲阜六十户”。 到清末，孔氏族人已分布到全国各地，散居于20余省，且往往聚族而居。其中以河北省为最多，称为“河西派”，是孔子三十二代孙、唐代文学馆学士孔颖达之后。 现在，孔子后裔已繁衍至八十三代，在世至少300余万人，其中在中国大陆约250万人，在香港、台湾地区以及韩国等海外各国，也分布着大批孔子后裔。 从元代开始，孔氏族人就开始向海外迁徙。孔子五十四代孙孔昭为高丽王所重用，其后代累世为官，名人辈出，成为朝鲜南部的望族。现在，孔子后裔已遍及世界各大洲，其中以韩国、朝鲜、日本、马来西亚、新加坡、印度尼西亚、缅甸、美国等国数量最多。